Websend добавляет в сервер возможность управлять командами и получать вывод прямо из веба - можно запускать консольные команды через страницу или из PHP-скрипта и видеть результат в браузере.
С ним легко сделать онлайн-консоль для админа, панель управления сервом, систему донатов с выдачей VIP, или быстрый интерфейс для контроля спавна, лута и прав игроков. Плагин работает в отдельном потоке - это значит, что запросы с сайта не будут лагать сервак. Поддерживается передача цветов в сообщениях, есть базовый контроль прав через permission websend и защита по хешу пароля, так что можно не бояться открывать доступ из веба. Можно использовать оба направления - PHP вызывает Bukkit, или Bukkit шлет данные на PHP и получает ответ.
Документация и исходники доступны на GitHub, но учти, проект официально не поддерживается - исходники под MIT, так что при необходимости можно допилить самому или взять на форк.
Плагин для удаленного управления сервером через веб, позволяет запускать команды и выводить их результат в браузере.